巧克力囊肿一般来由子宫内膜异位引起的，子宫内膜异位会影响正常的怀孕生育，假如异位病灶体积少，病情细微没有影响卵巢和输卵管，这还好，对自然怀孕的影响仍是比较的有限。可是，假如病情严重的话，会形成输卵管堵塞、腹腔粘连导致不能怀孕，巧克力囊影响卵巢正常的排卵导致精卵无法完成正常受精，因此形成不孕。

 

对于医治囊肿，现在有经过药物保存医治和手术两种方式，巧克力囊肿一般超过2厘米后，单纯地经过药物来保存医治作用很难操控囊肿的进一步发展，假如囊肿一直在增长，那就需要经过手术医治。

 

引起巧克力囊肿的具体发病机制现在也不是完全的清楚，可是和女人的个人体质会有很大的相关，和生活习惯、环境有关，和人体的雌性激素排泄有关。

 

发病机制不清楚一起它的术后复发率也很高，经过手术把病灶进行了切除，可是，一些微小的病灶有时是没有办法和其他的周围组织做一个明确的区别，在女人体质等一些条件的影响下，这些躲藏很深的病灶就会卷土重来，再次出现子宫内膜异位和卵巢巧克力囊肿。